Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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