Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRIP13Q15645 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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