Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AL357137.1-201ENST00000604645 203 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC046168.2-202ENST00000561123 926 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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