Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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