Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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