Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB1Q14028 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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CNGB1Q14028 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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CNGB1Q14028 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB1Q14028 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB1Q14028 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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CNGB1Q14028 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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CNGB1Q14028 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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CNGB1Q14028 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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CNGB1Q14028 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
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CNGB1Q14028 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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CNGB1Q14028 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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