Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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