Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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