Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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