Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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