Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NME3Q13232 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME3Q13232 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NME3Q13232 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NME3Q13232 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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