Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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