Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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