Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ANK3Q12955 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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