Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF2Q12933 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms