Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
STX4Q12846 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
STX4Q12846 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
STX4Q12846 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
STX4Q12846 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
STX4Q12846 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
STX4Q12846 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
STX4Q12846 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms