Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms