Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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