Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms