Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms