Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms