Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms