Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR3Q06889 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms