Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms