Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms