Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms