Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms