Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms