Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms