Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms