Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK17Q00537 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK17Q00537 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK17Q00537 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK17Q00537 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK17Q00537 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK17Q00537 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK17Q00537 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK17Q00537 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms