Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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