Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms