Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB1P82279 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB1P82279 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB1P82279 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB1P82279 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms