Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFI35P80217 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFI35P80217 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFI35P80217 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms