Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOMO3P69849 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms