Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms