Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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