Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRP54P61011 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP54P61011 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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