Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMSP52788 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMSP52788 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMSP52788 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMSP52788 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMSP52788 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMSP52788 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMSP52788 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMSP52788 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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