Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA2P51531 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms