Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms