Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFRP42898 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms