Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms