Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TSPOP30536 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms