Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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