Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms