Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms