Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XPAP23025 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XPAP23025 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XPAP23025 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms