Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1P21675 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF1P21675 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF1P21675 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms